Bioinformatique avec python et biopython

Gilles Hunault - Collection Sciences sup

224 pages, parution le 03/01/2024

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Résumé

La bioinformatique est une discipline essentielle de la biologie. L’objectif de cet ouvrage est de montrer par l’exemple des scripts Python et Biopython et d’établir un lien avec le concept biologique afférent, afin que le lecteur puisse développer ses propres scripts ou adapter ceux existants.
Le langage Python, par sa simplicité d’apprentissage, est particulièrement utilisé pour développer des applications. Biopython est un ensemble de scripts et d’outils, librement disponibles, permettant de développer des bibliothèques et des applications Python pour les besoins des travaux en bioinformatique.

L'auteur - Gilles Hunault

Gilles Hunault - Maître de conférences à l'université d'Angers. Il enseigne R depuis plus de 10 ans, en formation initiale à l'université et en formation continue (INRA, Institut Pasteur, etc.).

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Sommaire

Dénombrement des nucléotides et calculs associés.
Écriture de séquences d’acides nucléiques.
Séquences et expressions régulières.
Recherches bibliographiques dans PubMed.
Profil PFAM d’une famille de protéines.
Profil d’hydrophobicité d’une protéine – fenêtre de taille variable.
Position de cystéines impliquées dans un pont disulfure.
Calcul du barycentre d’une chaîne polypeptidique repliée.
Diagrammes de Ramachandran.
Contacts entre résidus d’acides aminés dans les structures 3D.
Superposition de structures protéiques.
Les protéines ou régions intrinsèquement désordonnées.
Alignements avec BLAST de séquences et protéines homologues.

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Caractéristiques techniques

	PAPIER	NUMERIQUE
Éditeur(s)	Dunod
Auteur(s)	Gilles Hunault
Collection	Sciences sup
Parution	03/01/2024	03/01/2024
Nb. de pages	224	-
Format	16.9 x 24	-
Couverture	Broché	-
Poids	390g	-
Contenu	-	PDF
EAN13	9782100858873	9782100868629