Analyse du génome et gestion des ressources génétiques forestières
Daniel Prat, Patricia Faivre Rampant, Emilce Prado - Collection Savoir Faire
Résumé
Les marqueurs génétiques sont largement utilisés aujourd'hui pour estimer le polymorphisme et prédire l'évolution des populations végétales. Au cours de ces dernières années, l'avancée dans la connaissance du génome des plantes a favorisé le développement de marqueurs moléculaires ciblant une région de l'un des génomes - nucléaire, chloroplastique et mitochondrial. Le développement de la génomique donne ainsi accès aux gènes contrôlant des caractères adaptatifs, particulièrement importants pour la gestion des ressources génétiques.
Si les arbres forestiers servent ici à illustrer les questions relatives à la gestion des ressources génétiques en raison de leur importante diversité et des menaces qui pèsent sur cette dernière, cet ouvrage est d'intérêt beaucoup plus général et concerne aussi la génomique et la génétique végétales.
Les principales méthodes d'analyse du génome sont décrites, ainsi que la plupart des marqueurs moléculaires et leurs caractéristiques : région du génome ciblée, hérédité, reproductibilité. En fonction des objectifs, des marqueurs sont proposés et leur utilisation discutée.
L'auteur - Daniel Prat
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Sommaire
- L'évaluation des ressources génétiques : l'analyse du polymorphisme
- Conservation des ressources génétiques forestières
- Classification des arbres forestiers
- Organisation des génomes des arbres forestiers
- Le génome nucléaire / Le génome chloroplastique /
- Le génome mitochondrial / L'évolution des génomes
- Variabilité génétique des arbres forestiers
- Ampleur de la variabilité / Evolution de la variabilité au cours des générations / Flux de gènes
- L'intérêt des marqueurs génétiques
- Informations attendues des marqueurs / Paramètres décrivant
- la variabilité génétique / Relations entre marqueurs génétiques et caractères quantitatifs
- Les outils d'analyse
- Les marqueurs génétiques
- Principes et généralités
- Marqueurs morphologiques
- Marqueurs biochimiques
- Produits du métabolisme secondaire / Isoenzymes /
- Protéines totales
- Marqueurs moléculaires
- Mise en évidence du polymorphisme / Description des marqueurs moléculaires / Marqueurs moléculaires de séquences exprimées /
- Polymorphisme de nucléotide unique (SNP)
- Reproductibilité
- Effet du prélèvement ou du tissu analysé / Difficultés techniques /
- Transfert entre laboratoires
- Hérédité
- Marqueurs du génome moléculaire / Marqueurs des génomes cytoplasmiques
- Automatisation et analyses
- Extraction et électrophorèse / Lectures de gels : analyse d'images /
- Puces à ADN / Programmes d'analyse de la diversité
- Cytologie
- Cytométrie
- Cytophotométrie / Cytométrie en flux
- Cytogénétique
- Hybridation in situ (HIS) / Hybridation de gènes (Fluorescent in situ hybridization, FISH) / Hybridation de génome (Génome in situ hybridization, GISH)
- Applications et choix des marqueurs
- Echantillonnage du génome
- Transfert des marqueurs entre espèces
- Adéquation marqueur - objectif
- Critères de choix / Utilisations et choix des marqueurs
- L'apport des marqueurs dans la gestion des ressources génétiques
- Systématique et phylogénie
- Histoire des populations
- Introgression
- Influence de grandes variations environnementales anciennes
- Gestion des ressources génétiques
- Evaluation des ressources génétiques / Gestion de réseaux de populations in situ / Ressources génétiques ex situ
Caractéristiques techniques
PAPIER | NUMERIQUE | |
Éditeur(s) | INRA | |
Auteur(s) | Daniel Prat, Patricia Faivre Rampant, Emilce Prado | |
Collection | Savoir Faire | |
Parution | 29/07/2006 | 01/06/2008 |
Nb. de pages | 456 | 484 |
Format | 16 x 24 | - |
Couverture | Broché | - |
Poids | 840g | - |
Intérieur | Noir et Blanc | - |
Contenu | - |
ePub + PDF + Mobi/Kindle |
EAN13 | 9782738012272 |
9782759201464 |
ISBN13 | 978-2-7380-1227-2 | - |
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