Etude metagenomique fonctionnelle de la rhizosphère d'erica andevale

Hicham Tahoune - Collection Omn.univ.europ.

52 pages, parution le 01/07/2018

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Résumé

Dernièrement, la metagenomique est apparue comme une alternative aux méthodes conventionnelles de screening microbiologique, puisqu'elle permet d'étudier d'une manière exhaustive les communautés microbiennes dans leur entourage naturel. Ici, on a utilisé cette technique pour évaluer l'extension et la diversité des mécanismes de résistance des communautés microbiennes associées à la rhizosphère d' Erica andevalensis, bruyère extremophile et endémique de la rivière Rio Tinto, Espagne. Pour cela on a construit une librairie metagenomique á base du plasmide pBluescript SKII+ comme vecteur de clonage, acceptant des inserts dont la taille peut varier entre 2500pb et 8000pb (paire de base). Notre librairie comprenait 60000 clones, auxquels nos avons soumis á la sélection de quatre antibiotiques : l'acide nalidixique, la tétracycline, la streptomycine et la kanamycine. Contre ce derniers, nous avons isolé un clone résistant avec une CMI = 10 g/ml. Le séquençage de l'insert et son analyse bioinformatique ultérieure a révélé qu'il s'agit d'un aminoglycoside phosphotransferase APH III qui agit par désactivation par phosphorisation de l'antibiotique.

Caractéristiques techniques

	PAPIER
Éditeur(s)	Editions universitaires européennes
Auteur(s)	Hicham Tahoune
Collection	Omn.univ.europ.
Parution	01/07/2018
Nb. de pages	52
Format	15.2 x 22.9
Couverture	Broché
Poids	92g
EAN13	9786138398271